ダウンロード

(Updated on 2015/12/7)


●ダウンロードについて

本プロジェクトではその成果を社会に還元する一環として、研究開発の成果物である、スーパーコンピュータ「京」で稼働する開発ソフトウェアをプロジェクト期間中(2006年10月〜2013年3月末)にソースコード・レベルで順次公開していきます。ただし一部の開発ソフトウェアについてはソースコードの公開ができないため、バイナリー・コードによる公開となります。 また中間成果物である、高並列クラスター上で稼働するバージョンも同様に可能な範囲で公開いたします。 産業界での利用、あるいは学生・大学院生の教育への活用など、広くご利用ください。 (本プロジェクトでは複数の大学、研究機関から研究開発者が参加・連携してプロジェクトを進めています。そのため、研究開発者の所属機関のダウンロードサイトにリンクしているケースもありますので、ご了承ください。またプロジェクトの進捗に合わせ、ダウンロードについての内容も更新されますので、最新情報についてはこのページでご確認ください。)

分子スケール・アプリケーション
分子スケールイメージ

量子科学計算(QM)、分子動力学計算(MM)、粗視化モデル計算(CG)の手法を結合したQM/MM、MM/CG法によって、マルチスケールシミュレーションを実現するためのプログラム。

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
M-1
mu2lib-K (開発コード名 Platypus-MM/CG)
ダウンロードのページ
理化学研究所
M-2
REIN-K (開発コード名Platypus-REIN)
ダウンロードのページ
理化学研究所
M-3
MARBLE-K
ダウンロードのページ
横浜市立大学
M-4
CafeMol-K
ダウンロードのページ
京都大学
M-5
ProteinDF-K
ダウンロードのページ
東京大学
M-6
RWFE-K (開発コード名 Platypus-QM/MM-FE)
ダウンロードのページ
京都大学
M-7
Platypus-QM-K
ダウンロードのページ
大阪大学
M-8
Platypus-QM/MM
予定
大阪大学

個々のコードについてはこちらをご覧ください。

研究チームのページはこちらです。
細胞スケール・アプリケーション
細胞スケールイメージ

細胞スケール研究の要となる、細胞シミュレーション統合プラットフォーム。

ボクセル分割で細胞内の現象をシミュレーション

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
C-1
RICS-K
ダウンロードのページ
理化学研究所

個々のコードについてはこちらをご覧ください。

臓器全身スケール・アプリケーション
臓器全身スケールイメージ

固体-流体連成による複雑な形状の血管内における変形赤血球の流れを再現した連続体力学シミュレーションに、細胞レベルからの血小板の凝集による血栓形成モデルを結合した血栓症シミュレータなど。

三次元流体・弾性体・弾性壁相互作用

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
O-1
ZZ-EFSI-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
O-2
PHITS-K (開発コード名 ZZ-DOSE)
ダウンロードのページ
理化学研究所
O-3
ZZ-HIFU-K
ダウンロードのページ
日本大学
O-4
UT-Heart
未定
東京大学

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データ解析融合アプリケーション
データ解析融合イメージ

肺がんと薬をテーマに、生体におけるネットワーク構造と動的シミュレーションモデルの推定、データ同化技術を活用したアプリケーション。

大規模遺伝子ネットワークの推定

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
D-1
ParaHaplo-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
D-2
NGS analyzer-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
D-3
ExRAT-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
D-4, 5,6
大規模遺伝子制御ネットワーク推定プログラム
(SiGN-BN, SiGN-L1,SiGN-SSMの3プログラムから構成されています)
SiGN-K
ダウンロードのページ
東京大学
D-7
SBiP
ダウンロードのページ
東京大学
D-8
LiSDAS-K
予定
統計数理研究所
D-9
MEGADOCK-K
予定
東京工業大

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脳神経系アプリケーション
脳神経アプリイメージ

神経細胞の発達・可塑に関する分子ネットワークと大脳皮質局所領域における細胞集団をシミュレーションするソフトウェア。また、脳における入出力情報処理の実時間シミュレーションを行うソフトウェア。

昆虫嗅覚系の全脳シミュレーション

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
B-1
NEST
ダウンロードのページ
理化学研究所
B-2
CMDN
予定
理化学研究所
B-3
VSM-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
B-4
NeuroMorphoKit-K
ダウンロードのページ
京都大学
B-5
IOSSIM-K
ダウンロードのページ
東京大学

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生命体基盤ソフトウェア
生命基盤イメージ

次世代スーパーコンピュータの持つ可能性を最大限引き出すための、超並列に対応した可視化ライブラリ、高並列計算コア、共通基盤ライブラリ(並列化ミドルウェア)、ワークフローツール。

超並列大規模分子動力学計算

番号
アプリケーション
コード名
ダウンロード
開発機関
H-1
cppmd-K
ダウンロードのページ
理化学研究所
H-2
ISL LSV
ダウンロードのページ
理化学研究所
H-3
ISL SPHERE
ダウンロードのページ
理化学研究所
H-4
VLSVL
予定
東京大学

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