(Updated on 2012/12/27)

●研究開発アプリケーションについて、日本製薬工業協会などで専門家向けに紹介した資料です。

量子科学計算(QM)、分子動力学計算(MM)、粗視化モデル計算(CG)の手法を結合したQM/MM、MM/CG法によって、マルチスケールシミュレーションを実現するためのプログラム。

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	細胞スケール研究の要となる、細胞シミュレーション統合プラットフォーム。
	ボクセル分割で細胞内の現象をシミュレーション

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	固体－流体連成による複雑な形状の血管内における変形赤血球の流れを再現した連続体力学シミュレーションに、細胞レベルからの血小板の凝集による血栓形成モデルを結合した血栓症シミュレータなど。
	三次元流体・弾性体・弾性壁相互作用

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	肺がんと薬をテーマに、生体におけるネットワーク構造と動的シミュレーションモデルの推定、データ同化技術を活用したアプリケーション。
	大規模遺伝子ネットワークの推定

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	神経細胞の発達・可塑に関する分子ネットワークと大脳皮質局所領域における細胞集団をシミュレーションするソフトウェア。また、脳における入出力情報処理の実時間シミュレーションを行うソフトウェア。
	昆虫嗅覚系の全脳シミュレーション

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	次世代スーパーコンピュータの持つ可能性を最大限引き出すための、超並列に対応した可視化ライブラリ、高並列計算コア、共通基盤ライブラリ（並列化ミドルウェア）、ワークフローツール。
	超並列大規模分子動力学計算

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本プロジェクトではスーパーコンピュータ「京」で利用するために研究開発中の上記アプリケーション・コードを順次公開し、産業界、大学、研究機関などの研究開発及び教育のために成果を還元してまいります。