「REIN-K」レプリカ交換分子動力学計算インターフェイス・ソフト講習会(実習つき)のご案内

   ―― 2014年バイオスーパーコンピューティング・ソフト講習会シリーズ ―――


次世代生命体統合シミュレーションソフトウェア研究開発プログラム(ISLiM)がスーパーコンピュータ「京」向けに開発したバイオスーパーコンピューティング・ソフトの中から、「REIN-K」の講習会(実習つき)を下記のとおり開催いたします。ぜひご利用ください。
実習には「京」と互換性のあるSCLSコンピューターを実習会場からオンラインで使用します。

REIN-K: レプリカ交換分子動力学計算インターフェイス・ソフトウェア
タンパク質のまわりの環境を含めたタンパク質の構造予測や、構造変化予測、自由エネルギー計算等を効率良く行なうためののプログラム。多次元レプリカ交換分子動力学計算を行なう。「京」に対応したMARBLEを分子動力学計算に用いるが、その他のプログラムにも対応可能。

- 主催: 理化学研究所 情報基盤センター
- 共催: HPCI戦略プログラム 戦略分野1
- 協賛: バイオグリッドセンター関西、バイオスーパーコンピューティング研究会 


● 開催日時: 2014年2月26日(水) (13:30-17:30) 受付開始 12:45
● 会場: 公益財団法人都市活力研究所 (NPO法人バイオグリッドセンター関西) 会議室 地図
   (大阪市北区大深町3-1グランフロント大阪 タワーC 7F)
   TEL:06-6359-1322
● 申し込み締切り: 2014年2月17日(月)
● 参加申し込み: 定員に達しましたので、参加申し込み受付は終了しました。
なお参加にあたっては
  • - 実習のためのノートPC(無線LAN機能必須)をご持参ください。
  • - UNIX基本コマンドの使用経験がある程度必要です。
  • - SCLS公募の「応募資格」を満たしていることが条件となります。
● 参加費: 無料
● 講習会プログラム (時間割については変更される可能性があります。予めご 了承ください。) (配布資料 pdf)
  • 開始: 13:30 (受付開始 12:45)
  •  (13:30-15:00) 1. REIN-K 講習
  •  (15:00-17:30) 2. SCLSコンピューターを使用したREIN-K 実習および質疑応答
  • 終了: 17:30
   講師 宮下尚之 (REIN-K開発者、理研 生命システム研究センター (QBiC))

● その他
  • - 参加者は、復習およびトライアル計算のために実習日から一週間(実習日を含 む)SCLSコンピューターを利用できます。
  • - SCLSコンピューター: 「京」と互換性を有する計算機で、生命科学を 研究される企業および大学等研究機関の方々には、登録の上、無料で提供して います。

問い合わせ先: ISLiM研究開発ソフト・アウトリーチ担当 (Email: islim-scls-contact@riken.jp)


――――― 参加申込書 (ここから) ―――――
定員に達しましたので、参加申し込み受付は終了しました。
宛先: islim-scls-contact@riken.jp

*** REIN-K 講習会 (実習つき) 参加申込書 ***

REIN-K 講習会 (実習つき)に申し込みますので、SCLSコンピューター利用に必要 な下記書類を添付します。

□  利用アカウント申請書 (既存ユーザーは不要)
□  承諾書 (民間企業所属の方のみ必要)
□  SSH公開鍵(テキストファイル) (既存ユーザーは不要)

所属:
氏名:
連絡用Email:

――――― ここまで ―――――