次世代生命体統合シミュレーションソフトウェア研究開発プログラム(ISLiM)がスーパーコンピュータ「京」向けに開発したバイオスーパーコンピューティング・ソフトの中から、「REIN-K」と 「CafeMol」の講習会を下記のとおり開催いたします。
昨年度の講習会以降の研究開発進捗状況をできるだけ反映した内容を予定しています。ぜひご利用ください。
なお本講習会は東京と大阪の会場をPolycom TV会議システムで結び、講義形式で同時開催します。実習はおこないませんが、ソフトウェアの導入・利用方法・解析例等についても詳しくふれます。

●　REIN-K: レプリカ交換分子動力学計算インターフェイス・ソフトウェア
タンパク質のまわりの環境を含めたタンパク質の構造予測や、構造変化予測、自由エネルギー計算等を効率良く行なうためののプログラム。多次元レプリカ交換分子動力学計算を行なう。「京」用にhybrid並列コンパイルしたNAMDを分子動力学計算に用いるが、その他のプログラムにも対応予定。

●「CafeMol」粗視化分子モデル計算ソフト
粗視化された分子モデルによる古典分子動力学法により大規模生体分子の長時間シミュレーションを行うソフトウェア。解析例として、キネシンの動態、多剤排出トランスポーターの動態、DNAヒストン複合系（ヌクレオソーム）などがある。


- 主催: 理化学研究所 情報基盤センター
- 共催: HPCI戦略プログラム 分野1、都市活力研究所
- 協賛: バイオグリッドセンター関西、バイオスーパーコンピューティング研究会、
　 　　産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 HPCI人材養成プログラム

記