2014年度「MARBLE-K」利用講習会のご案内
―― 2014年バイオスーパーコンピューティング・ソフト講習会シリーズ ―――
MARBLEは横浜市立大学大学院生命医科学研究科生命情報科学研究室で、池口満徳准教授を中心に開発されたプログラムです。
次世代生命体統合シミュレーションソフトウェア研究開発プログラム（ISLiM, URL: http://www.csrp.riken.jp)において、「京」コンピュータ用のプログラムMARBLE-Kとして開発・改良を行ったバージョンを現在公開しております。
URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/bioinfo/marble/
このたび、MARBLE-Kの概要ならびにこれまで行われた研究の一端を紹介するとともに、実際にMARBLE-Kを使った分子シミュレーションを体験していただく利用講習会を行います。すでに分子シミュレーションを行っている方から、これから生体高分子の分子シミュレーションを行おうと思っている初心者の方まで、皆様方の参加をお待ちしております。
＜MARBLE-Kについて＞ 蛋白質を主体とした生体高分子の全原子分子動力学計算に特化したシミュレーションプログラムです。X線・中性子溶液散乱、NMR、質量分析等、各種構造生物学データを活用した生体分子構造機能解析を行うことを目指して開発しました。
- 主催: 横浜市立大学
- 共催: 文部科学省 創薬等支援技術基盤プラットフォーム
- 後援: バイオスーパーコンピューティング研究会、
理化学研究所 情報基盤センター、HPCI戦略プログラム 戦略分野1
バイオグリッドセンター関西、都市活力研究所、
産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
次世代生命体統合シミュレーションソフトウェア研究開発プログラム（ISLiM, URL: http://www.csrp.riken.jp)において、「京」コンピュータ用のプログラムMARBLE-Kとして開発・改良を行ったバージョンを現在公開しております。
URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/bioinfo/marble/
このたび、MARBLE-Kの概要ならびにこれまで行われた研究の一端を紹介するとともに、実際にMARBLE-Kを使った分子シミュレーションを体験していただく利用講習会を行います。すでに分子シミュレーションを行っている方から、これから生体高分子の分子シミュレーションを行おうと思っている初心者の方まで、皆様方の参加をお待ちしております。
＜MARBLE-Kについて＞ 蛋白質を主体とした生体高分子の全原子分子動力学計算に特化したシミュレーションプログラムです。X線・中性子溶液散乱、NMR、質量分析等、各種構造生物学データを活用した生体分子構造機能解析を行うことを目指して開発しました。
- 主催: 横浜市立大学
- 共催: 文部科学省 創薬等支援技術基盤プラットフォーム
- 後援: バイオスーパーコンピューティング研究会、
理化学研究所 情報基盤センター、HPCI戦略プログラム 戦略分野1
バイオグリッドセンター関西、都市活力研究所、
産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
記
● 開催日時: 開催日時： 2014年10月24日（金）13:30-17:00 (受付開始 13:00)
● 会場: 横浜市立大学 鶴見キャンパス 情報実習室（２階) 地図
横浜市鶴見区末広町1-7-29
●対 象: MARBLE-Kを使って、生体分子のシミュレーションを始めたいとお考えの方
● 参加費: 無料 (※但し事前申込が必要です)
● 講習会プログラム (
配布資料)
- (1) MARBLE-Kの概要（池口満徳 准教授・横浜市立大学)
- (2) MARBLE-Kを用いた研究例（山根 努 横浜市立大学）
- (3) MARBLEによる分子動力学シミュレーションの実習
● 定員: 10名程度
● 申込締切り: 2014年10月22日(金) (但し定員になり次第、締切りとなります)
● 参加申し込み書: 以下の情報をご記入の上、 marble-lec@tsurumi.yokohama-cu.ac.jp 宛てにE-mailでお申し込み下さい。
- 件名: MARBLE-K 利用講習会の申込み
- ご所属:
- 部署名:
- お名前:
- E-mail:
- 住所:
● 問合せ・申込み先: E-mail: marble-lec@tsurumi.yokohama-cu.ac.jp
● 注意事項
- 本講習会では横浜市立大学 情報実習室の実習用PCを使用します。受講者のPC持参は不要です。また受講者持参のPCは利用できません。