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次世代スーパーコンピュータプロジェクト

「次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発」シンポジウム

第2回　バイオスーパーコンピューティングシンポジウム

多数の方々のご参加をいただきました。どうもありがとうございました。
また、来年お会いしましょう。

理化学研究所　次世代計算科学開発プログラム
プログラムディレクター　　　茅　　　幸　二

開催日：2010年3月18日（木）、19日（金）
開催地：MY PLAZA ホール（東京都千代田区丸の内2-1-1）
使用言語：英語
参加者数：約200名

Theme

Toward integrative understanding of the live phenomena, current status and the future

Outline

１）Ｐｒｏｇｒａｍ
２）ポスターセッション
 ３）問合せ先

Program

March 18th (Thu.)

10:00-11:15	Opening Session
	Opening address 茅　幸二 (理化学研究所　次世代計算科学プログラムディレクター)
	Keynote lecture High performance and distributed computing in biomedical research Prof. Peter Coveney (University College London)(Invited) abstract
11:15-11:30	Break
11:30-12:30	Flash Talks for Poster Presentation I
12:30-14:00	Lunch and Poster Session
14:00-16:15	Molecular Scale Session
	Simulations of lipid nano-containers mimicking primitive cells Prof. Siewert Jan Marrink (University of Groningen)(Invited) abstract
	Forces and Conformatoinal Dynamics in Biomolecular Nanomachines Dr. Helmut Grubmüller (Max Planck Institute for Biophysical Chemistry)(Invited) abstract
	Simulations of biomolecular functions by a simultaneous use of three levels of molecular simulations, QM, MM, and CG 木寺　詔紀　 (理化学研究所　次世代計算科学プログラム　次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ　分子スケール研究開発チーム　チームリーダー) abstract
16:15-16:30	Break
16:30-18:00	Cell Scale Session
	Towards the Systems Biology of Tissues: Predicting liver regeneration and tumor growth Dr. Dirk Drasdo (INRIA)(Invited) abstract
	Research and Development of Cell Scale Simulation Team 横田　秀夫(理化学研究所　次世代計算科学プログラム　次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ　細胞スケール研究開発チーム　リーダー) abstract
18:30-20:00	Reception

March 19th (Fri.)

10:00-11:30	Organ and Body Scale Session
	Toward Useful Biomedical Models Dr. Grace C. Y. Peng (NIH)(Invited) abstract
	高木　周 (理化学研究所　次世代計算科学プログラム　次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ　臓器全身スケール研究開発チーム　リーダー) abstract
11:30-11:45	Break
11:45-12:45	Flash Talks for Poster Presentation II
12:45-14:15	Lunch and Poster Session
14:15-15:45	Data Analysis Fusion Session
	Issues in Management and Analysis of Genomic Data at Large Scale Mr. Matthew Trunnell (Broad Institute of MIT and Harvard)(Invited) abstract
	Can supercomputer hack cancer systems? 宮野　悟 (理化学研究所　次世代計算科学プログラム　次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ　データ解析融合研究開発チーム　リーダー) abstract
15:45-16:00	Break
16:00-17:30	Brain and Neural Systems Session
	Integration and Differentiation: Changing Scientific Publication and Communication with Models Prof. James M. Bower (University of Texas Health Science Center)(Invited) abstract
	石井　信 (理化学研究所　次世代計算科学プログラム　次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ　脳神経系研究開発チーム　リーダー) abstract
17:30-17:45	Report on the Poster Sessions
	中村　春木 (バイオスーパーコンピューティング研究会　会長)
17:45-18:00	Closing Session
	Closing address 姫野　龍太郎 (理化学研究所次世代計算科学プログラム　副プログラムディレクター)

ポスターセッション

今年は７２名の発表がありました。次の方が、表彰されましたので、報告します。ポスターセッションの審査は、バイオスーパーコンピューティング研究会にご支援をいただきました。

Best Poster Award

No	氏名	所属先	タイトル
12	Xin--Qiu Yao	Department of Biophysics, Kyoto University	Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation

Poster Award

No	氏名	所属先	タイトル
10	Fumiko Ogushi (小串典子)	RIKEN Advanced Science Institute	Flip-Flop motions of cholesterol, diacylglycerol, and ceramide in phospholipid bilayers
29	Ayako Yachie-Kinoshita (谷内江綾子)	Department of Biochemistry & Integrative Medical Biology, School of Medicine, Keio University	Development of hepatic lobular model of metabolion based on large-scale biosimulation at individual cellular level
46	Fuyou Liang (梁　夫友)	Computational Science Research Program, RIKEN	Geometrical Multi-scale Modeling of Cardiovascular Hemodynamics: Towards Super Large-scale Hemodynamic Simulation
57	Yoshinori Tamada (玉田嘉紀)	Human Genome Center, Institute of Medical Science, The University of Tokyo	Parallel algorithms for estimating multi-scale gene networks using nonparametric Bayesian Networks
62	Tobias C. Potjans	Institute of Neurosciences and Medicine, Research Center Juelich	Brain-scale neuronal network simulations: linking local microcircuitry and macroscopic connectivity
67	Yohei Sato (佐藤　陽平)	Graduate School of Information Science and Technology, the University of Tokyo	Implementing multi-compartment model simulation in the Premotor area of the insect brain: toward whole brain network simulation
72	Daisuke Watanabe (渡邉大介)	Computational Science Research Program, RIKEN	Efficient I/O Technique of Large-Scale Data by Fast Compression