ポスターセッション発表一覧 | |||
No. | 氏 名 | 所 属 | 発表タイトル |
P-01 | 須永 泰弘 | 理化学研究所 次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ | 細胞シミュレーション統合プラットフォームの開発 |
P-02 | 大日向 大地 | (株)富士通長野システムエンジニアリング | 三次元細胞シミュレータの開発 |
P-03 | 谷内江 綾子 | 慶應義塾大学医学部医化学教室 | 網羅的代謝解析により強化された肝細胞代謝モデルの開発と応用 |
P-04 | 谷内江 綾子 | 慶應義塾大学医学部医化学教室 | 赤血球代謝モデルの応用と4D細胞シミュレーションへの拡張 |
P-05 | 七澤 洋平 | 東海大学医学部内科学系循環器内科 (細胞スケール) | 血小板細胞シミュレータの大規模化に向けて |
P-06 | 田口 尚貴 | 立教大学 | 赤色蛍光タンパク質の励起状態に関する理論的研究 |
P-07 | 寺田 透 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム 分子スケール研究開発チーム | 分極可能な力場パラメータに基づくペプチドの自由エネルギーマップ |
P-08 | 近藤 寛子 | 東京大学 新領域創成科学研究科 | Investigation of domain motions in proteins by molecular dynamics simulations |
P-09 | 服部洋介、直島好伸 | 岡山理科大学大学院総合情報研究科 | エイズ治療薬の効能と副作用の評価に向けた生体分子計算シミュレーション |
P-10 | 今井 隆志 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム | 3次元分布関数理論に基づくリガンド結合予測:T4リゾチーム変異体におけるベンゼンの結合 |
P-11 | 古田 忠臣 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム | 脂肪酸β酸化酵素複合体の分子動力学シミュレーション |
P-12 | 矢城陽一朗、田中孝尚、今川 敦、木村崇知、亀澤 誠、直島好伸 | 岡山理科大学大学院総合情報研究科 | フラグメント分子軌道法による酵素リパーゼの鏡像体選択性に関する生体分子量子化学計算 |
P-13 | 森次 圭 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム | 生体高分子のマルチスケールシミュレーションに向けた粗視化モデル法 |
P-14 | 検崎 博生 | 京都大学理学研究科生物物理教室高田研究室 | タンパク質-DNA複合体の粗視化モデルによるシミュレーション |
P-15 | 下山 紘充 | 大阪大学蛋白質研究所 | 自由エネルギー地形探索のためのAAM/CGM連成計算法 |
P-16 | 日比野 浩 | 大阪大学大学院医学系研究科 薬理学講座 分子細胞薬理学講座 | 内耳蝸牛内高電位の成立機構のモデル化 |
P-17 | 高橋 恒一 | 理化学研究所 基幹研究所 | 細胞の生化学シミュレーションとスーパーコンピューティングへの期待 |
P-18 | 田村 典子 | 東海大学医学部内科学系 循環器内科 助教 | 血流条件下、血小板内カルシウムイオンの局在 |
P-19 | 竹川 久美子 | 神戸大学大学院工学研究科情報知能学専攻 玉置研究室 CS14 | 膵臓β細胞におけるインスリン顆粒動態シミュレーション・モデル |
P-20 | 山下 篤 | 宮崎大学医学部病理学講座 | 家兎プラークびらんモデルとシミュレーションによる血栓発症機序の解析 |
P-21 | 本田 直樹 | 九州大学 理学研究院 | Stochastic control of spontaneous signal generation for gradient sensing in chemotaxis |
P-22 | 臼井 支朗 | 理化学研究所 脳科学総合研究センター ニューロインフォマティクス技術開発チーム | PLATO: Platform for collaborative brain system modeling〜視覚系の大規模数理モデル構築に向けて〜 |
P-23 | 半田 高史 | 理研BSI 脳回路機能理論研究チーム | 行動選択における大脳皮質局所回路のダイナミクスの生理学的解析とデータベース構築 |
P-24 | 本田 稔 | 東京大学 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 | STDPによる網膜視蓋系での方向選択性の学習 |
P-25 | 神崎 亮平 | 東京大学 先端科学技術研究センター | 昆虫の嗅覚系全脳シミュレーション |
P-26 | 高橋 卓也 | 立命館大学生命科学部 生命情報学科 准教授 | 溶質分子周囲の水のダイナミックス計算:分子の電荷と形の効果 |
P-27 | 山中 秀介 | 大阪大学蛋白質研究所蛋白質情報科学系 | イオンラジカル系の為のQM理論=共鳴CI法の開発 |
P-28 | 米澤 康滋 | 大阪大学蛋白質研究所 | 生体高分子を対象とした超並列 ab initio QM/MD 連成計算プログラム(platypus:PLATform for dYnamic Protein Unified Simulation)の開発と、ab initio QM/MD による Pin1 のPPIase酵素反応機構の研究 |
P-29 | 柴崎洋平、 藤本佳則、 直島好伸 | 岡山理科大学大学院総合情報研究科 | 未来型糖質甘味剤の開発に向けた分子計算シミュレーション |
P-30 | 宮下 尚之 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム 分子スケールチーム | アミロイド前駆体蛋白質の膜貫通部位の二量体化構造予測 |
P-31 | 藤崎 弘士 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ分子スケール研究開発チーム | キサンチン酸化還元酵素のダイナミクスと阻害剤への影響 |
P-32 | 山崎 秀樹 | 大阪大学蛋白質研究所 | 光合成反応中心スペシャルペアの電子非対称性に関する理論解析 |
P-33 | 平野 秀典 | 慶應義塾大学医学部薬理学教室 | 分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究 |
P-34 | 末永 敦 | 理化学研究所ASI 高速分子シミュレーション研究チーム | 計算科学的手法を用いたEGFレセプター高親和性人工リガンドの分子設計 |
P-35 | 平野 敏行、 上村(西野) 典子、 恒川 直樹、 西村 康幸、千葉 貢治、 岡本 正宏、 佐藤 文俊 | 東京大学生産技術研究所 | タンパク質全電子シミュレーションシステムの開発 |
P-36 | Markus Diesmann | 次世代計算科学研究開発プログラム・脳神経系研究開発チーム | Towards brain-scale simulations with the NEST-simulation tool |
P-37 | 姜 時友 | 理化学研究所脳科学総合研究センター・脳回路機能理論研究チーム | 現実的な大脳皮質神経回路における自発的なUP-DOWN状態間移の自己組織化 |
P-38 | 池野 英利 | 兵庫県立大学 | 昆虫嗅覚系全脳シミュレーションに向けたデータベース環境 |
P-39 | 作村 諭一 | 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 | A quantitative description of polarization in neural morphology |
P-40 | 山尾 将隆 | 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 | Collective cell migration driven by random fluctuations |
P-41 | 杉山 和靖 | 東京大学大学院工学系研究科機械工学専攻 | A new fluid-structure coupling simulation method on Eulerian frame using Finite difference scheme |
P-42 | 山村 直人 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム 臓器全身スケール研究開発チーム | 骨格筋シミュレータの開発 |
P-43 | 石川 顕一 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム・臓器 全身スケール研究開発チーム |
モンテカルロ法による重粒子線治療シミュレーターの開発 |
P-44 | 伊井 仁志 | 東京大学大学院工学系研究科 | オイラー定式化による流体・構造体連成解析手法の高精度化 |
P-45 | 沖田 浩平 | 理化学研究所 | アレイトランスデューサを利用したHIFU療法に対する数値解析 |
P-46 | 渡邉 博文 | 神戸大学大学院人間発達環境学研究科田中成典研究室 | Structure
Based Drug Designにおける計算手法の評価
(1) フラグメント分子軌道法によるタンパク質・リガンド結合エネルギー |
P-47 | 沖本 憲明 | 理化学研究所研 基幹研究所 高速分子シミュレーション研究チーム | Structure
Based Drug Designにおける計算手法の評価 (2) MM-PB/SA法およびQM-MM法によるタンパク質-リガンド結合親和性の予測 |
P-48 | 谷田 義明 | 富士通研究所ナノテクノロジー研究センター | Structure
Based Drug Designにおける計算手法の評価 (3) MP-CAFEE法によるタンパク質-リガンド結合親和性の予測 |
P-49 | 竹松 和友 | 神戸大学大学院人間発達環境学研究科 田中成典研究室 | 赤血球凝集反応実験と量子化学計算に基づくインフルエンザウイルス・ヘマグルチニンの変異予測 |
P-50 | 二木 紀行 | 理化学研究所システム計算生物学研究グループ高速分子シミュレーション研究チーム | 薬剤特異性の計算機シミュレーション解析による医薬品副作用の予測 |
P-51 | 沖山 佳生 | 神戸大学大学院人間発達環境学研究科 | フラグメント分子軌道法を用いたポリペプチドのESP電荷の決定とMD応用 |
P-52 | 三井 崇志 | 慶應義塾大学 | 薬剤標的タンパク質MDM2とその高親和性ペプチド間の結合自由エネルギー計算に基づく相互作用解析 |
P-53 | 池口満徳、山根努、苙口友隆 | 横浜市立大学 | 全原子分子動力学シミュレーションシステムの開発 |
P-54 | 林 重彦 | 京都大学大学院理学研究科 | ハイブリッド QM/MM 法を用いたタンパク質機能の解析 |
P-55 | 梁 夫友 | 理化学研究所 | 1-D model of the circle of Willis coupled with a global model of the cardiovascular system |
P-56 | 中尾 賢司 | 広島大学大学院工学研究科 | 生体力学シミュレーションのためのボクセル固体-流体連成解析手法 |
P-57 | 永沢 理 | 千葉大学大学院 工学研究科 | 病変部を有する大動脈内の血流相互作用に関する計算力学的検討 |
P-58 | 片岡 弘之 | 理化学研究所臓器全身スケール研究開発チーム | Euler型解法による超弾性体構造FEMの圧縮性流体に基づいた定式化 |
P-59 | 森 太志 | 北陸先端科学技術大学院大学 | ステント留置術による術後形状と健康状態を仮定した形状の血流シミュレーションによる評価 |
P-60 | 熊畑 清 | 北陸先端科学技術大学院大学 | ボクセルデータによる心臓シミュレーションのためのオイラーベース流体構造連成解析コードの開発 |
P-61 | 伊東 聰 | 理研 次世代計算科学 生命体基盤ソフトウェア開発・高度化チーム | SPHEREフレームワークの非構造格子計算法への拡張 |
P-62 | 大野 洋介 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム 次世代生命体統合シミュレーション研究推進グループ 生命体基盤ソフトウェア開発・高度化チーム | 生命体基盤ソフトウェアの開発・高度化 |
P-63 | Hong LUO | 鳥取大学薬学部 | Leads and Targets Scanning from Nature Products: Cross Search with Traditional Chinese Medicine, Omics, Molecular Simulation and Chemical Biology |
P-64 | 秋山 泰 | 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 秋山研究室 | A GPGPU-based massively parallel computing system for mapping vast amounts of short DNA fragments onto a full-genome template |
P-65 | 秋山 泰 (他3名) |
東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 秋山研究室 | MEGADOCK - A massively parallel software system for all-to-all protein docking analysis with pre-calculated Fourier library of protein structures |
P-66 | 松崎 由理 (他3名) |
東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 秋山研究室 | In silico screening method of protein-protein interactions using all-to-all rigid docking and clustering: with application to pathway analysis. |
P-67 | 三澤 計治 | 理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム | 全ゲノム関連解析に向けた、多重検定における有意水準補正のためのアルゴリズム開発 |
P-68 | 山口 類 | 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | 生命体データ同化へ向けたパスウェイモデルおよび諸手法の開発 |
P-69 | 藤本 明洋 | 理化学研究所 | 大規模多型データの解析による機能的多型の探索 |
P-70 | 田崎 真哉 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻ゲノム制御医科学分野 | 定量的チロシンリン酸化時系列情報に基づくEGFRシグナル伝達のシステム的解析 |
P-71 | 中村 和幸 | 統計数理研究所 | ペタスケールコンピューティングに向けた超多数粒子フィルタの実装:遺伝子ネットワークモデルのパラメータ推定への適用 |
P-72 | 中道礼一郎 角田達彦 |
理化学研究所 ゲノム医科学研究センター | 遺伝子間相互作用を考慮した複数SNPの高速ゲノムワイド関連解析と大規模計算機への適用 |
P-73 | 玉田 嘉紀 | 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター DNA情報解析分野 | ベイジアンネットワークによる大規模遺伝子ネットワーク推定ソフトウェアの研究開発とその応用事例 |
P-74 | 島村 徹平 | 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | 再帰的正則化法による大規模遺伝子ネットワークの推定とアプリケーションソフトウェアL1GNEについて |
P-75 | 斎藤 正也 | 統計数理研究所 | 並列演算アクセラレータを活用した粒子フィルタ計算の高速化−予備実験と研究計画− |
P-76 | 阿部 貴志 | 長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部 | 世界最高水準スーパーコンピュータで可能になる、全ゲノム・全タンパク質配列を対象にした大規模ポストゲノム解析 |